El proyecto AMS-02, que abarca la segunda etapa del programa, fue organizado por el Departamento de Energía de Estados Unidos en 1999 con la cooperación de otros 15 países. Dicho proyecto tiene como meta detectar la materia oscura y antimateria del cosmos, con miras a estudiar la Gran Explosión (Big Bang), y la formación del Universo.
Este detector de partículas ha sido instalado en la Estación Espacial Internacional, pero puede ser controlado desde la Tierra. El primer proyecto AMS (AMS-01) comenzó en 1994, empleando equipo enviado en el transbordador espacial Discovery, que orbitó la Tierra por diez días en su misión espacial inicial en 1998. El proyecto AMS-02 comenzó en 1999, pero el módulo no fue entregado sino hasta mayo de este año para ser enviado en el último vuelo espacial del transbordador Endeavour.
Lee Shih-chang, investigador de la Academia Sínica y coordinador en Taiwan del proyecto de AMS, el Instituto Chungshan de Ciencias y Tecnología, institución de investigación militar, la Universidad Nacional Central y la Academia Sínica han hecho la petición para albergar dicho centro de control.
Los ambiciosos proyectos de AMS son presididos por el ganador del Premio Nobel de Física, Samuel Chao Chung Ting, quien es también un académico de la Academia Sínica.
El sistema demostrará la capacidad de Taiwan en investigación y desarrollo; así como en sistemas para estudiar el cosmos.